Молекулярні біологи з США представили комп'ютерну симуляцію, на якій показано взаємодію капсиду (зовнішньої білкової оболонки) вірусу імунодефіциту людини з навколишнім середовищем.
Відповідний ролик опубліковано на сайті Іллінойського університету в Урбані-Шампейні.
На ньому показані жовті і сині частки – вхідні та вихідні з капсида іони – всередині вірусу.
Негативні іони, як показало моделювання, про яке повідомляється в журналі Nature Communications, накопичуються на позитивно зарядженій поверхні всередині капсида, тоді як позитивні розташовуються зовні. Саме останні притягують негативно заряджені нуклеотиди, з яких складається ДНК клітини, в яку впроваджується ВІЛ.
При певному значенні різниці потенціалів можливий розрив стінки капсида. Дану уразливість ВІЛ вчені планують використовувати для профілактики і лікування ВІЛ-інфекції.
Комп'ютерна модель капсида включає в себе 64 мільйони атомів. Симуляція створена з використанням методів молекулярної динаміки. Необхідні розрахунки проводилися протягом двох років на суперкомп'ютерах Titan і Blue Waters
Читайте також:
- В Україні з'явилися нові ліки для ВІЛ-інфікованих
- ВООЗ попереджає про загрозу поширення невиліковної хвороби
- Як в Києві борються з ВІЛ: у місті запрацювала нова програма з безкоштовними тестами
- Одеські туберкульозні клініки об'єднали з центром ВІЛ
- Чарлі Шин зустрічається з найкращою подругою колишньої дружини
- Чарлі Шин, який бореться з ВІЛ, завів новий роман
- Дизайнери людського генома: що таке Crispr/Cas і як скоро вчені почнуть міняти ДНК поки ненароджених дітей
- Люди з ВІЛ-позитивним статусом намагаються через суд домогтися зниження ціни на ліки